Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C4orf46Q504U0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C4orf46Q504U0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C4orf46Q504U0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms