Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VWA3BQ502W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VWA3BQ502W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
VWA3BQ502W6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VWA3BQ502W6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms