Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BBS9Q3SYG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BBS9Q3SYG4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BBS9Q3SYG4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms