Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PFKFB3Q16875 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PFKFB3Q16875 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PFKFB3Q16875 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms