Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HADHQ16836 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHQ16836 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HADHQ16836 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHQ16836 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HADHQ16836 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HADHQ16836 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HADHQ16836 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HADHQ16836 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HADHQ16836 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HADHQ16836 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HADHQ16836 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HADHQ16836 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HADHQ16836 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HADHQ16836 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HADHQ16836 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms