Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDR2Q16832 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDR2Q16832 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDR2Q16832 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms