Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3AQ16821 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3AQ16821 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PPP1R3AQ16821 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPP1R3AQ16821 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R3AQ16821 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms