Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2B3Q16720 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP2B3Q16720 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP2B3Q16720 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP2B3Q16720 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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