Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCBQ16585 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGCBQ16585 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGCBQ16585 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms