Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ACKR1Q16570 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACKR1Q16570 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms