Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCSK7Q16549 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCSK7Q16549 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCSK7Q16549 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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