Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
MRPL23Q16540 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL23Q16540 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL23Q16540 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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