Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HMGN3Q15651 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HMGN3Q15651 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HMGN3Q15651 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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