Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SF3B3Q15393 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SF3B3Q15393 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SF3B3Q15393 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
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