Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RCN1Q15293 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RCN1Q15293 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms