Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDCD1Q15116 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PDCD1Q15116 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PDCD1Q15116 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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