Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RUNX3Q13761 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RUNX3Q13761 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RUNX3Q13761 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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