Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PMS2P11Q13670 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PMS2P11Q13670 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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