Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TPBGQ13641 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPBGQ13641 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TPBGQ13641 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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