Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TOP3AQ13472 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOP3AQ13472 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOP3AQ13472 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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