Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MSLNQ13421 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MSLNQ13421 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSLNQ13421 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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