Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MRPL49Q13405 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL49Q13405 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL49Q13405 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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