Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MTA1Q13330 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTA1Q13330 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MTA1Q13330 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms