Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTGDRQ13258 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTGDRQ13258 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGDRQ13258 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
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