Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMAN2Q12907 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMAN2Q12907 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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