Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXO1Q12778 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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