Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 RBD2YPL246C 789 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YBR226CYBR226C 411 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YHR219WYHR219W 1875 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 ERO1YML130C 1692 nt8.14□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 LAS1YKR063C 1509 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 PEX3YDR329C 1326 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 ATP16YDL004W 483 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 TRR1YDR353W 960 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 LNP1YHR192W 837 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 SPC34YKR037C 888 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 TEX1YNL253W 1269 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MPD2YOL088C 834 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 CCL1YPR025C 1182 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 snR31snR31 225 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 ARO4YBR249C 1113 nt8.13□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 BEM1YBR200W 1656 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YNL011CYNL011C 1335 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YDL172CYDL172C 480 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 OCA6YDR067C 675 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 KEG1YFR042W 603 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 ELA1YNL230C 1140 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 UMP1YBR173C 447 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MRS2YOR334W 1413 nt8.12□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 snR83snR83 306 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 DET1YDR051C 1005 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YGL138CYGL138C 1038 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 SYF2YGR129W 648 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 AIM19YIL087C 474 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YLR042CYLR042C 486 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 REC102YLR329W 795 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 PGA2YNL149C 390 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 DUG3YNL191W 1074 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YOR292CYOR292C 930 nt8.11□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 TAF8YML114C 1533 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 FCF1YDR339C 570 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 HRA1HRA1 564 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MRPL4YLR439W 960 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YBL029WYBL029W 1131 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 SEN15YMR059W 387 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YNR062CYNR062C 984 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 GLO4YOR040W 858 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YMR265CYMR265C 1386 nt8.1□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 MTH1YDR277C 1302 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YHL012WYHL012W 1482 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 KRR1YCL059C 951 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 CPR4YCR069W 957 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YDR282CYDR282C 1245 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 RPN14YGL004C 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 TAN1YGL232W 870 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 ERG27YLR100W 1044 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 PML39YML107C 1005 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YOR338WYOR338W 1092 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 HAP5YOR358W 729 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 HST2YPL015C 1074 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YPL108WYPL108W 507 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 VMA11YPL234C 495 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 LDB16YCL005W 771 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 VPS36YLR417W 1701 nt8.09□□□□□ -1.11
TFB4Q12004 SUV3YPL029W 2214 nt8.09□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 STF1YDL130W-A 261 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 ARO3YDR035W 1113 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 EFG1YGR271C-A 702 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 DOG2YHR043C 741 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 DOG1YHR044C 741 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YLR049CYLR049C 1287 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YPT11YNL304W 1254 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 GDA1YEL042W 1557 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 ITR2YOL103W 1830 nt8.08□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 MET1YKR069W 1782 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 SRM1YGL097W 1449 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 WTM2YOR229W 1404 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 PLP1YDR183W 693 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 LRS4YDR439W 1044 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YGR115CYGR115C 780 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YJR142WYJR142W 1029 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YMR010WYMR010W 1218 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 SHE1YBL031W 1017 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YPL199CYPL199C 723 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 CIK1YMR198W 1785 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 SRP54YPR088C 1626 nt8.07□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YFR020WYFR020W 699 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 RFA3YJL173C 369 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 PER33YLR064W 822 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 SIC1YLR079W 855 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 RPN13YLR421C 471 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YOX1YML027W 1158 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 YOR238WYOR238W 912 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 NBA1YOL070C 1506 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 SES1YDR023W 1389 nt8.06□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 INH1YDL181W 258 nt8.05□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.05□□□□□ -1.12
TFB4Q12004 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87 ms