Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFFO1Q0D2I5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFFO1Q0D2I5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFFO1Q0D2I5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms