Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 RAD3YER171W 2337 nt6.76□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 UTR4YEL038W 684 nt6.76□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt6.76□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 CMK2YOL016C 1344 nt6.76□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 NPA3YJR072C 1158 nt6.75□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 ATP4YPL078C 735 nt6.75□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SMC5YOL034W 3282 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 HAP2YGL237C 798 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 RME1YGR044C 903 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 IPI1YHR085W 1005 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YJL211CYJL211C 444 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 ETR1YBR026C 1143 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YPR123CYPR123C 435 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 MTC1YJL123C 1437 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 MRC1YCL061C 3291 nt6.74□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YER010CYER010C 705 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YHR127WYHR127W 732 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.73□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 XBP1YIL101C 1944 nt6.72□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 TPK1YJL164C 1194 nt6.72□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YJU3YKL094W 942 nt6.72□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.72□□□□□ -1.33
CTI6Q08923 YIL055CYIL055C 1884 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 SSK22YCR073C 3996 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 YLL059CYLL059C 507 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 STM1YLR150W 822 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 ECM15YBL001C 315 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 PGA3YML125C 939 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 VMA4YOR332W 702 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 CBC2YPL178W 627 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 PKC1YBL105C 3456 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 VPS4YPR173C 1314 nt6.71□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 SHE10YGL228W 1734 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 MNN5YJL186W 1761 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 CLB1YGR108W 1416 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 RPL7AYGL076C 735 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 ORM1YGR038W 669 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 HCR1YLR192C 798 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 RPL7BYPL198W 735 nt6.7□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 PAT1YCR077C 2391 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 KEL1YHR158C 3495 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 OST3YOR085W 1053 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 YPK2YMR104C 2034 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 BUL1YMR275C 2931 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 EEB1YPL095C 1371 nt6.69□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 TDH3YGR192C 999 nt6.68□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 PHO8YDR481C 1701 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 CHS5YLR330W 2016 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 RSA4YCR072C 1548 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 YME1YPR024W 2244 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 CWC21YDR482C 408 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 KSS1YGR040W 1107 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 IFA38YBR159W 1044 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 SPS22YCL048W 1392 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 KEX2YNL238W 2445 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 DIA3YDL024C 1407 nt6.67□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 HGH1YGR187C 1185 nt6.66□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 POM33YLL023C 840 nt6.66□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 YOL163WYOL163W 510 nt6.66□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 MLC2YPR188C 492 nt6.66□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 MTC5YDR128W 3447 nt6.66□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 IES1YFL013C 2079 nt6.65□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 KTR5YNL029C 1569 nt6.65□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 SCO2YBR024W 906 nt6.65□□□□□ -1.34
CTI6Q08923 NPL6YMR091C 1308 nt6.65□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YDR401WYDR401W 564 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 RPS2YGL123W 765 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 MRS1YIR021W 1092 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YJL068CYJL068C 900 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 GAT3YLR013W 426 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 SWP1YMR149W 861 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 RPS15YOL040C 429 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 HST2YPL015C 1074 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 GPA1YHR005C 1419 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 HEL1YKR017C 1656 nt6.64□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 TFC6YDR362C 2019 nt6.63□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 ERC1YHR032W 1746 nt6.63□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 TAL1YLR354C 1008 nt6.63□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 GUA1YMR217W 1578 nt6.63□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 YBR016WYBR016W 387 nt6.63□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 ALT1YLR089C 1779 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 TOS4YLR183C 1470 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 TRK2YKR050W 2670 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 MRPL4YLR439W 960 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 SER1YOR184W 1188 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 RPN7YPR108W 1290 nt6.62□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 DPH2YKL191W 1605 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 CMR1YDL156W 1569 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 UGO1YDR470C 1509 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 CLB2YPR119W 1476 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 RPT1YKL145W 1404 nt6.61□□□□□ -1.35
CTI6Q08923 RET1YOR207C 3450 nt6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 106 ms