Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSC1Q08554 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DSC1Q08554 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms