Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PDE4CQ08493 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4CQ08493 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms