Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LOXL1Q08397 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LOXL1Q08397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LOXL1Q08397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms