Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAX8Q06710 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms