Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CACNG1Q06432 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNG1Q06432 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNG1Q06432 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms