Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 HST3YOR025W 1344 nt5.64□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YHL017WYHL017W 1599 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 RRN3YKL125W 1884 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 DBP8YHR169W 1296 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 SPO7YAL009W 780 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YNL019CYNL019C 855 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YNL033WYNL033W 855 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 AAD15YOL165C 432 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YPR114WYPR114W 948 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 PRP24YMR268C 1335 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 TNA1YGR260W 1605 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YCK1YHR135C 1617 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 MET7YOR241W 1647 nt5.63□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 MDM31YHR194W 1740 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YAP1801YHR161C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 DON1YDR273W 1098 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 TOM20YGR082W 552 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 MRS1YIR021W 1092 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YIR042CYIR042C 711 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YJL193WYJL193W 1209 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 DAP1YPL170W 459 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 ECM33YBR078W 1290 nt5.62□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 PGK1YCR012W 1251 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YGL185CYGL185C 1140 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 CBP4YGR174C 513 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YJR085CYJR085C 318 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 CKA2YOR061W 1020 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 SFB3YHR098C 2790 nt5.61□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 RAD24YER173W 1980 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 MNN2YBR015C 1794 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 MRK1YDL079C 1506 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 CDC19YAL038W 1503 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 GRX4YER174C 735 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 TMT1YER175C 900 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 ORM1YGR038W 669 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 YML083CYML083C 1257 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 RPN7YPR108W 1290 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 DRS1YLL008W 2259 nt5.6□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 COR1YBL045C 1374 nt5.59□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 ARO10YDR380W 1908 nt5.59□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 TRP1YDR007W 675 nt5.59□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 EFM3YJR129C 1020 nt5.59□□□□□ -1.51
RRN11Q04712 PUF3YLL013C 2640 nt5.59□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 ATE1YGL017W 1512 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 RPT3YDR394W 1287 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YKL223WYKL223W 333 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 RPL10YLR075W 666 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 EXO1YOR033C 2109 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 ATG12YBR217W 561 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 VPS5YOR069W 2028 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YGL036WYGL036W 2730 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 UBA1YKL210W 3075 nt5.58□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 SEC18YBR080C 2277 nt5.57□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YDL119CYDL119C 924 nt5.57□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YOL163WYOL163W 510 nt5.57□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 PET112YBL080C 1626 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 RPR2YIR015W 435 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YKR073CYKR073C 321 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 IMA1YGR287C 1770 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YFL042CYFL042C 2025 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 ERC1YHR032W 1746 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 ATG4YNL223W 1485 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 UBA2YDR390C 1911 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 BRL1YHR036W 1416 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 ARN2YHL047C 1863 nt5.56□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 MNN5YJL186W 1761 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 VID30YGL227W 2877 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 VPS4YPR173C 1314 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 PYC2YBR218C 3543 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 CNE1YAL058W 1509 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 SOG2YOR353C 2376 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 JJJ3YJR097W 519 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 IFA38YBR159W 1044 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 OCA5YHL029C 2040 nt5.55□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 IES1YFL013C 2079 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 GUD1YDL238C 1470 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 VPS72YDR485C 2388 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 SNO4YMR322C 714 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 DOM34YNL001W 1161 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 POR1YNL055C 852 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 UBC11YOR339C 471 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 HSP33YOR391C 714 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 REG2YBR050C 1017 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 HSP32YPL280W 714 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 SEC39YLR440C 2130 nt5.54□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 AVO1YOL078W 3531 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 RHB1YCR027C 630 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 RPT6YGL048C 1218 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 WTM2YOR229W 1404 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 YTP1YNL237W 1380 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 DBF4YDR052C 2115 nt5.53□□□□□ -1.52
RRN11Q04712 PDE1YGL248W 1110 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 ELA1YNL230C 1140 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 EEB1YPL095C 1371 nt5.52□□□□□ -1.53
RRN11Q04712 KKQ8YKL168C 2175 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66 ms