Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
UBXN1Q04323 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN1Q04323 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN1Q04323 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms