Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNFAIP2Q03169 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNFAIP2Q03169 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNFAIP2Q03169 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms