Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EXOSC10Q01780 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EXOSC10Q01780 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms