Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXC5Q00444 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC5Q00444 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms