Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX1P83916 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX1P83916 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX1P83916 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX1P83916 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBX1P83916 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBX1P83916 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBX1P83916 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBX1P83916 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBX1P83916 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX1P83916 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX1P83916 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBX1P83916 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX1P83916 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX1P83916 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX1P83916 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBX1P83916 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX1P83916 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX1P83916 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX1P83916 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CBX1P83916 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBX1P83916 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBX1P83916 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBX1P83916 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBX1P83916 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX1P83916 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBX1P83916 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX1P83916 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBX1P83916 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBX1P83916 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms