Protein–RNA interactions for Protein: P78371

CCT2, T-complex protein 1 subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT2P78371 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT2P78371 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT2P78371 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCT2P78371 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCT2P78371 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT2P78371 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT2P78371 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT2P78371 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT2P78371 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCT2P78371 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCT2P78371 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCT2P78371 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCT2P78371 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCT2P78371 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCT2P78371 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCT2P78371 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT2P78371 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT2P78371 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCT2P78371 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT2P78371 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT2P78371 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT2P78371 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCT2P78371 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT2P78371 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCT2P78371 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT2P78371 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCT2P78371 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCT2P78371 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT2P78371 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT2P78371 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT2P78371 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCT2P78371 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT2P78371 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT2P78371 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT2P78371 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCT2P78371 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCT2P78371 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCT2P78371 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCT2P78371 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCT2P78371 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCT2P78371 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms