Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BP2P78314 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH3BP2P78314 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH3BP2P78314 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms