Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBA1P69905 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBA1P69905 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HBA1P69905 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HBA1P69905 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBA1P69905 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBA1P69905 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBA1P69905 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBA1P69905 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HBA1P69905 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HBA1P69905 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBA1P69905 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBA1P69905 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBA1P69905 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBA1P69905 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBA1P69905 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms