Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBB4BP68371 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBB4BP68371 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms