Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RPS28P62857 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPS28P62857 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPS28P62857 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPS28P62857 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RPS28P62857 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RPS28P62857 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPS28P62857 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS28P62857 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS28P62857 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS28P62857 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPS28P62857 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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