Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNRPFP62306 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPFP62306 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms