Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RPS29P62273 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RPS29P62273 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RPS29P62273 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS29P62273 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS29P62273 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RPS29P62273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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