Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1CAP62136 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1CAP62136 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PPP1CAP62136 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1CAP62136 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms