Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP46P62068 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP46P62068 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP46P62068 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP46P62068 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP46P62068 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP46P62068 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP46P62068 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP46P62068 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP46P62068 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP46P62068 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP46P62068 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP46P62068 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP46P62068 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP46P62068 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP46P62068 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP46P62068 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP46P62068 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP46P62068 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP46P62068 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP46P62068 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP46P62068 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP46P62068 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP46P62068 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP46P62068 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP46P62068 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP46P62068 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP46P62068 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP46P62068 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP46P62068 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP46P62068 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP46P62068 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP46P62068 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP46P62068 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP46P62068 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP46P62068 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP46P62068 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP46P62068 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP46P62068 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP46P62068 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms