Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCCD1P59942 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCCD1P59942 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCCD1P59942 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms